Gente, no se si se acuerdan que esto pasaba también con las aplicaciones programadas en Visual Basic 6, para el cual teníamos el mágigo DoEvents, que lo que hacía no era más que decirle al sistema operativo que se acuerde que hay que refrescar el display. Bueno después de buscar miles, leer sobre threads y demás encontré una solución tan sencilla como el DoEvents.
Simplemente agreguen al bucle (for while, lo que sea):
display.readAndDispatch();
Donde display es el display que creo la shell compisite o lo que fuese. Esto se complica cuando no es un bucle el que está consumiendo mucho si no una sola instrucción, para eso les recomiendo que lean esto:
http://book.javanb.com/swt-the-standard-widget-toolkit/ch05lev1sec7.html
Saludos y espero que les sirva.
MN